炎症性肠病患者肠道微生物肠型与代谢组的整合分析及其与疾病严重程度和精神共病的关联

背景 肠道微生物群与炎症性肠病（IBD）相关，但患者间微生物失调的变异特征仍未得到充分阐明。肠-脑轴被认为与IBD患者高发的精神共病有关，但相关的微生物及代谢介质尚未完全明确。 方法 我们纳入了71名健康个体和178名IBD患者（104例溃疡性结肠炎，74例克罗恩病），对其粪便进行了宏基因组测序和非靶向代谢组学测序。采用非负矩阵分解（NMF）共识聚类界定肠道微生物群肠型，随后进行整合多组学与临床相关性分析。 结果 NMF在IBD患者中识别出两种稳健的肠型：GET-B（拟杆菌科富集，n = 112... [1234 chars]